Лаборатория молекулярной биологии

 

Заведующая лабораторией: Гриценко Диляра Александровна, PhD

Тел/факс: +77073865386

E-mail: d.kopytina@mail.ru

Scopus

Researcher ID Web of Science

ORCID ID 

Researchgate

 

Заведующая лабораторией: Заведующая лабораторией Гриценко Диляра Александровна. Работает в должности заведующей лабораторией с 2019 года. С 2006 по 2010 гг. обучалась в бакалавриате с получением диплома с отличием бакалавра техники и технологий, КазНУ им. аль-Фараби. С 2010 по 2012 обучалась в магистратуре с последующим получением диплома с отличием Магистра естественных наук, КазНУ им. аль-Фараби.  В 2019 году защитила докторскую диссертацию по теме «Создание вирусного вектора для получения рекомбинантных белков в растениях и исследование эффективности их экспрессии». В рамках выполнения докторской диссертации проходила стажировку в лаборатории имени Толковского, Институт защиты растений, Волкани центр, Израиль. В 2011 году была награждена «Назарбаевской стипендией» президентом страны за отличные показатели в учебе, за высокие достижения в научно-исследовательской работе. Автор более 50 научных работ, индекс Хирша – 5.

Миссия лаборатории: обеспечение продовольственной безопасности страны путем фундаментальных и прикладных исследований в области растениеводства, рационального использования генетических ресурсов и защиты растений. Развитие современных технологий и знаний для защиты стратегически важных сельскохозяйственных культур. Развитие прикладных исследований по разработке систем диагностики экономически важных фитопатогенов, детекции и идентификации карантинных вредителей и патогенов, генетической паспортизации сельскохозяйственных культур.

Состав лаборатории:

PhD Гриценко Д. А., заведующая лабораторией

PhD Низамдинова Г. К., старший научный сотрудник

PhD Хуснитдинова М.А., старший научный сотрудник

Пожарский А.С., научный сотрудник

Капытина А.И., младший научный сотрудник

Керімбек Н.М., младший научный сотрудник

Таскужина А.К., младший научный сотрудник

Костюкова В.С., младший научный сотрудник

Кенжебекова Р.Т., младший научный сотрудник

Колченко М.В., лаборант

Адильбаева К.С., лаборант

Моисеев Р.М., лаборант

Мендыбаева А, лаборант

Махамбетов А.Н., лаборант

Даирбекова З.К., лаборант

Ельчанинов М.И., лаборант

Oсновные направления научной деятельности лаборатории:

  • Идентификация и молекулярно-генетические исследования фитопатогенов и вредителей;
  • Разработка рекомбинантных молекул для целей биотехнологии;
  • Полногеномные исследования патогенов и вредителей растений;
  • Изучение фитопатологических и генетических аспектов популяций дикой и культурной яблони;
  • Генетический потенциал устойчивости картофеля к основным болезням и вредителям;
  • Изучение генетического разнообразия местной селекционной коллекции сортов томата;
  • Изучение генетического потенциала сахарной свеклы и ее фитопатологического статуса;
  • Сотрудничество и услуги по молекулярногенетическим исследованиям;

Основные результаты деятельности:

  • Налажена система регенерации различных сортов винограда из меристематической и апикальной ткани;
  • Разработана система одновременной диагностики шести вирусов винограда (ArMV, GFkV, GFLV, GVA, GLRV-1, GLRV-3);
  • Разработана система одновременной диагностики пяти вирусов яблони (ASGV, ASPV, ACLSV, ApMV, ToRSV).
  • Проведен анализ генетического разнообразия популяций дикой яблони Казахстана с использованием ДНК маркеров
  • Генотипированы технические и столовые сорта винограда казахстанской и зарубежной селекции, культивируемые в Казахстане.
  • Разработаны вирусные векторы на основе генома вируса А винограда для экспрессии гетерологичных белков в растениях
  • Разработана высокочувствительная система диагностики Erwiniaamylovora (бактериальный ожог плодово-ягодных культур), основанная на использовании метода петлевой изометрической амплификации нуклеиновых кислот.
  • Налажена система обнаружения ГМО.

 

Услуги:

Детекция вирусных патогенов:

  • Вирус А винограда
  • Вирус короткоузлия винограда
  • Вирус скручивания листьев винограда-1 и 3
  • Вирус мозаики Arabis
  • Вирус крапчатости винограда
  • Вирус хлоротической пятнистости листьев яблони
  • Вирус бороздчатости ствола яблони
  • Вирус растрескивания ствола яблони
  • Вирус мозаики яблони
  • Вирус кольцевой пятнистости томата
  • Вирус коричневой морщинистости плодов томата (ToBRFV)
  • Вирус штриховатой мозаики ячменя
  • Вирус мозаики полос пшеницы
  • Эмаравирус мозаики пшеницы
  • Вирус некротическое пожелтение жилок свеклы
  • Вирус крапчатости листьев малины (RLMV)
  • Вирус пятнистости листьев малины (RLBV)

Детекция бактериальных патогенов:

  • Бактериальный ожог плодовых
  • Бурая гниль картофеля

Детекция грибных патогенов:

  • Монилиоз плодовых культур

Идентификация насекомых методом ПЦР:

  • Непарный шелкопряд
  • Нематоды

 

Основные публикации за 2019-2024 годы:

           Kapytina A, Kolchenko M, Kerimbek N, Pozharskiy AS, Nizamdinova G, Taskuzhina A, Adilbayeva K, Khusnitdinova M, Amidullayeva M, Moisseyev R, et al. Distribution of Wheat-Infecting Viruses and Genetic Variability of Wheat Streak Mosaic Virus and Barley Stripe Mosaic Virus in Kazakhstan. Viruses. 2024; 16(1):96. https://doi.org/10.3390/v16010096

  1. Gritsenko D. et al. First evaluation of genetic diversity among honeybee populations in Kazakhstan // Apidologie. 2023. 54, № 6. P. 61.
  2. Khusnitdinova M. et al. Problems and prospects of sugar beet cultivation in Kazakhstan (Changed title according to reviewers’ comments) // Agronomy Research. 2023. Vol. 21.
  3. Kairova G. et al. Evaluation of Fire Blight Resistance of Eleven Apple Rootstocks Grown in Kazakhstani Fields // Applied Sciences. 2023. Vol. 13, № 20. P. 11530.
  4. Kolchenko M. et al. Wild Malus niedzwetzkyana Dieck ex Koehne as a Genetic Resource for Fire Blight Resistance // Horticulturae. 2023. Vol. 9, № 10. P. 1066.
  5. Pozharskiy A. et al. Genetic structure and genome-wide association study of the traditional Kazakh horses // animal. 2023. P. 100926.
  6. Kolchenko M. et al. Genetic Characterization of Raspberry Bushy Dwarf Virus Isolated from Red Raspberry in Kazakhstan: 4 // Viruses. Multidisciplinary Digital Publishing Institute, 2023. Vol. 15, № 4. P. 975.
  7. Gritsenko D. et al. Investigation of mutation load and rate in androgenic mutant lines of rapeseed in early generations evaluated by high-density SNP genotyping // Heliyon. Elsevier, 2023. Vol. 9, № 3.
  8. Pozharskiy A. et al. Genetic diversity of the breeding collection of tomato varieties in Kazakhstan assessed using SSR, SCAR and CAPS markers // PeerJ. 2023. Vol. 11. P. e15683.
  9. Kairova G, Daulet N, Solomadin M, Sandybayev N, Orkara S, Beloussov V, Kerimbek N, Gritsenko D, Sapakhova Z. Identification of Apple Varieties Resistant to Fire Blight (Erwinia amylovora) Using Molecular Markers. Horticulturae. 2023; 9(9):1000. https://doi.org/10.3390/horticulturae9091000
  10. Pozharskiy A. et al. MLO Proteins from Tomato (Solanum lycopersicum L.) and Related Species in the Broad Phylogenetic Context: 12 // Plants. Multidisciplinary Digital Publishing Institute, 2022. Vol. 11, № 12. P. 1588.
  11. Gritsenko D. et al. Apple varieties from Kazakhstan and their relation to foreign cultivars assessed with RosBREED 10K SNP array // Europ.J.Hortic.Sci. 2022. Vol. 87, № 1.
  12. Gritsenko D. et al. Development of primer sets for detection of Raspberry leaf blotch virus and Raspberry leaf mottle virus by multiplex RT-PCR // Eurasian Journal of Applied Biotechnology. № 1.
  13. Pozharskiy A. et al. Screening a collection of local and foreign varieties of Solanum lycopersicum L. in Kazakhstan for genetic markers of resistance against three tomato viruses // Heliyon. 2022. Vol. 8, № 8. P. e10095.
  14. Zhigailov, A. V., Stanbekova, G. E., Nizkorodova, A. S., Galiakparov, N. N., Gritsenko, D. A., Polimbetova, N. S., … & Iskakov, B. K. (2022). Phosphorylation of the alpha-subunit of plant eukaryotic initiation factor 2 prevents its association with polysomes but does not considerably suppress protein synthesis., 111190.
  15. S. Pozharskiy, K.P. Aubakirova, Gritsenko D.A., N.I. Tlevlesov, N.Zh. Karimov, N.N. Galiakparov, N.A. Ryabushkina. (2020) Genotyping and morphometric analysis of Kazakhstani grapevine cultivars versus Asian and European cultivars// Genet. Mol. Res., vol. 19, no. 1. DOI: 10.4238/gmr18482
  16. Pozharskiy, A., Khamzina, A., Gritsenko, D., Khamzina, Z., Kassymbekova, S., Karimov, N., … & Tlevlesov, N. (2020). SNP genotyping and population analysis of five indigenous Kazakh sheep breeds. Livestock Science, 241, 104252.
  17. Karpova, A. Alexandrova, E. Yeriskina, R. Kryldakov, D. Gritsenko, N. Galiakparov, B. Iskakov Andean and Ordinary Strains of Potato Virus S Infecting Potatoes in Southern Kazakhstan // Plant Disease, Vol.104, No.2, P. 599, 2020. https://doi.org/10.26577/ijbch.2020.v13.i1.13.
  18. Gritsenko, D.. et al. Simultaneous detection of five apple viruses by RT-PCR. International Journal of Biology and Chemistry, [S.l.], v. 13, n. 1, p. 129-134, aug. 2020. ISSN 2409-370X.
  19. Gritsenko, D.A., Kenzhebekova, R.T., Deryabina, N.D., Galiakparov N.N. Development of a “deconstructed” vector based on the genome of grapevine virus A // Plant Biotechnol Rep. -2019. — Vol. 13. — P. 169-177. https://link.springer.com/article/10.1007/s11816-019-00528-1
  20. Gritsenko, D., Pozharsky, A, Deryabina, N., Kassenova, A, Galiakparov N. Genetic analysis of hemagglutinin proteins of H3 and H1 subtypes in Kazakhstan // Genetika, 2019. DOI: 10.2298/GENSR1902511G.

 

Патенты

  1. Гриценко Д.А., Гриценко И.С. Авторское свидетельство на компьютерную программу DNARNAref, ИС 009529, №1890 (2017 г), МЮРК.
  2. Сагитов А.О., Дуйсембеков Б.А., Жанарбекова А.Б., Копжасаров Б.К., Калдыбеккызы Г., Джаймурзина А.А., Динасилов А.С., Бекназарова З.Б., Сарбасова А.М., Дарубаев А.А., Сейсенова А.А., Джумахан Д.М., Самбетова Т.С., Гриценко Д.А. Авторское свидетельство «Прикладные научные исследования в области защиты и карантина растений для обеспечения фитосанитарной безопасности Республики Казахстан (произведение науки)», №0645 (2018 г)
  3. Галиакпаров Н.Н., Омашева М., Гриценко Д.А. Патент на изобретение «Набор синтетических олигонуклеотидов для обнаружения вирусов яблони методом ОТ-ПЦР», №33634 (2019 г)

https://gosreestr.kazpatent.kz/Invention/DownLoadFilePdf?patentId=283865&lang=ru

  1. Галиакпаров Н.Н., Гриценко Д.А., Дерябина Н.Н. Патент на изобретение «Вирусный вектор для транзиентной экспрессии гетерологичных белков в растениях», 33632 (2019 г)

https://gosreestr.kazpatent.kz/Invention/DownLoadFilePdf?patentId=283863&lang=ru

  1. Галиакпаров Н.Н., Гриценко Д.А., Дерябина Н.Н. Патент на полезную модель № 4583 (2019 г) «Т-вектор для клонирования ПЦР – продуктов разного размера»

https://gosreestr.kazpatent.kz/Utilitymodel/Details?docNumber=316755

  1. Гриценко Д.А., Галиакпаров Н.Н. Патент на полезную модель «Комплекс антигенов вируса гриппа подтипа H3N8», №5764 (2020 г).
  2. Гриценко Д.А., Капытина А.И., Керимбек Н. Патент на полезную модель № 7018 (2022) «Набор синтетических олигонуклеотидов для обнаружения вируса кольцевой пятнистости малины»
  3. Гриценко Д.А., Пожарский А.С., Костюкова В.С., Адильбаева К. Патент на полезную модель № 7296 (2022) «Набор синтетических олигонуклеотидов для обнаружения вируса коричневого морщинистого плода томата»
  4. Гриценко Д.А., Пожарский А.С., Таскужина А.К. Патент на изобретение № 36219 (2023) «Набор высокоспецифичных олигонуклеотидов для обнаружения пяти вирусов картофеля в растительном материале».

 

 

Контактные данные:

87273947768, +77073865386 — Гриценко Диляра Александровна, заведующая лабораторией d.kopytina@gmail.com

+77477237558 — Низамдинова Г. К., старший научный сотрудник nizamdin13@gmail.com